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このページは、研究室の次期クラスター機の試験のために購入した 省電力PCの組み立ての記録である。質問にはお答えできません。 まだデータを入力中です。（2008.9.5)
購入業者 マイスペック・コム（042-370-6952)
最新の Linux Fedora 8 に Intel Fortran 10.1 をインストール しようとする方も多いと思いますが、Fedora 8 を default で入れた ままではインストールに失敗します。私の経験を書いておきますので、 参考にして下さい。尚、Fortran 10.1 では SSE4 演算命令が使え、 45nm の新しい CPU では割り算などが高速に実行されます。
1) 環境設定 Fedora は 7 以後、tcsh, emacs が default ではインストールされて ないので、これらを使う場合、まずネットワーク環境を設定してから、
yum install tcsh yum install emacs
というコマンドでインストールする必要がある。
2) Intel コンパイラ Intel コンパイラは gcc の上で動くので、Linux（SUSEでも）の インストールの際（或いはインストール後追加で）、gcc などの 開発環境をインストールしておく必要がある。次に、Fedora 7 & 8 では、 Intel コンパイラで必要な libstdc++.so.5 がシステム上に存在しない ため（libstdc++.so.6になっている）、そのままではインストールに 失敗する。そこで、libstdc++.so.5 を次のコマンドで取ってくる。
yum -y install compat-libstdc++-33
これで libstdc++.so.5 をインストールできるので、後は Intel Fortran の
http://downloadcenter.intel.com/Detail_Desc.aspx?ProductID=907&DwnldID=4977&lang=jpn
URL ロケーションの場所をクリックする。 downloadをするのは1番とMKL。 展開してcd l_fc_p_10.1.018 ./install.sh をする。 メッセージを読みｙ,accept,enterを入力する。
終了後、
cd /opt/intel/fc/10.1.018/bin に移動し、
rootで次のコマンドを入力
tcsh source ./ifortvars.csh
これでパスが通り終了となる。
コンパイルはifortで行う。
横山さんによって、８コア全て動かした状況で電力測定171W。 省電力CPUでないものは196W。アイドル時は90W。計算時間は、省電力CPUと違いが無い。
インストールの方法 : http://pccluster.web.fc2.com/MPI.html
tar -zxf mpich2-1.0.7.tar.gz cd mpich2-1.0.7 ./configure make su make install
環境設定 "通常のユーザーアカウント"で cd $HOME touch .mpd.conf chmod 600 .mpd.conf
.mpd.confを編集 secretword="研究室指定” コンピュータの一覧ファイルを作成 ~/mpd.hosts に sskn
http://flex.phys.tohoku.ac.jp/japanese/riron/tool/mpi/ よりhello.fをコピー
[sasa@sskn ~]$ mpdboot -n 1 -f mpd.hosts [sasa@sskn ~]$ mpif77 hello.f [sasa@sskn ~]$ mpiexec -n 4 ./a.out Hello World. myrank = 2 , tnode = 4 Hello World. myrank = 1 , tnode = 4 Hello World. myrank = 0 , tnode = 4 Hello World. myrank = 3 , tnode = 4
次に２台のマシン（ssknとfuru）の並列を試みた。
sftp sskn
put .mpd.conf
のコマンドでfuruの.mpd.confをssknにコピー。
次に両方のマシンのファイアーウオールを無効にし
mpdboot -n 2 -f mpd.hosts
を行ったところ、
failed to handshake with mpd on furu
というメッセージがでた。
http://www.geocities.jp/turtle_wide/tools/sshpass.html
でdsa の方法で設定すると flex に自宅からパスワードなしで ssh できるようになった。
究極の作業としてHDDを抜いて、HDDなしでLinuxを立ち上げる。HDDは親の機械をマウントして使う。
http://mitty.jp/pc/networkboot/
を参考に挑戦
---------------------------------------------------------------------------
(A) (A') (B) (B') (C) (D) (D') (F)
CPU C2Q C2Q MacPro 自作 Xeon Xeon PentiumD
Clock 2.4GHz 2.66GHz Xeon(3.0GHz) 2.66GHz 2.5/2.66 3.0GHz
プロセス (65nm) (45nm) (65nm) (45nm) (45nm) (45nm)
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メモリ種類 |----Unbuf.ECC---| FB-DIMM Reg.ECC FB-DIMM Reg.ECC DDR2
搭載メモリ |------ 8GB -----| 14GB 12GB 16GB 8GB 12GB16GB 2GB
|今回計算で|
|使用メモリ| 1.30GB 0.55GB 0.81GB 1.31GB 1.31GB |--0.55GB--| 1.3+0.3GB
(B') (E) (E') (L)
稼働コア数 |--------------------- 消費電力(W)--------------------------|
idle 108 86 258 123 200 94 97 92 133
1 136 100 308 136 216 111 110 | 200
2 156 116 332 151 230 127 123 | 263
3 172 128 382 166 246 140 136 | -
4 187 138 409 180 263 156 149 | -
5 - - 437 193 276 166 160 | -
6 - - 470 208 289 175 172 | -
7 - - 494 220 302 185 184 | -
8 - - 520 233 318 194 196 171 -
--------------------------------------------------------------------------
(A) Core2quad Q6600 2.40GHz (1CPU, 4 cores) FSB1066
D975Xchipset, 8GB Unbuf.ECC DIMM (DDR2-667) （価格は15万くらい）
(A') Core2quad Q9450 2.66GHz (1CPU, 4 cores) FSB1333
X38chipset, 8GB Unbuf.ECC DIMM (DDR2-667) （総額 13万くらい）
(B) Xeon E5365 3.0GHz (2CPU, 8 cores) FSB1333
Mac Pro, 14GB FB-DIMM (DDR2-667) （価格は60万くらい）
(B') ２．参照（下記）
(C) Xeon E5430 2.66GHz (2CPU, 8 cores) FSB1333
5400chipset, 16GB FB-DIMM (DDR2-533) （価格は30万くらい）
*(D)-(E) Xeon E5420 2.50GHz (2CPU, 8 cores) FSB1333 [#a0489359]
5100chipset, 8GB Registered ECC (DDR2-533) (価格は20万くらい)
*(D)-(E') Xeon E5430 2.66GHz (2CPU, 8 cores) FSB1333 [#oca53210]
5100chipset, 12GB Registered ECC (DDR2-533) (価格は20万くらい)
*(D')-(L) Xeon L5420 2.50GHz (2CPU, 8 cores) FSB1333 [#zc6a3461]
5100chipset, 16(4*4)GB Registered ECC
(F) Pentium D 3.0GHz (1CPU, 2 cores)
2GB non-ECC (DDR2-400) (2年半使用、価格：当時13万くらい)
---
２．計算能力（以前と同じデータ） 行った計算は、私の変分モンテカルロの計算（１９６サイト）で、 (i) ボソンに対する配列の入れ替え及び条件判別が中心の計算 (ii) フェルミオンに対する配列（或る程度の行列演算）の入れ替え中心 (iii) フェルミオンに対する行列と行列式演算が中心の計算 の3種類（前回と同一のもの）。所要時間の結果は以下の通り。 計算所要時間（単位：秒） ---------------------------------------------------------------- 機種 clock (i) (ii) (iii) OS Fortran ---------------------------------------------------------------- (A) C2Q 2.4G 718.4 196.99 148.17 Fedora6 Intel v9.1 (A')C2Q 2.66G 583.2 172.48 136.33 Fedora8 Intel v10.1 (B) Pro 3.0G 529.7 163.23 132.27 MacOS X Intel v9.1 (B')Xeon 3.0G 522.0 152.98 120.47 Fodora8 Intel v10.1 (C) Xeon 2.66G 580.8 170.90 134.77 Fedora6 Intel v10.1 (D) Xeon 2.5G 619.6 183.10 144.83 Fedora8 Intel v10.1 (D')Xeon 2.5G(L) 615.4 180.77 144.36 Fedora8 Intel v10.1 (E) G5 2.5G 1286.3 347.74 167.26 MacOS X IBM XLv8.1 (F) PD 3.0G 1089.2 509.77 316.45 SUSE10 Intel v9.1 --------------------------------------------------------------- (A)-(D),(A'),(D'),(F) 上記１．と同じ機種 (B') Xeon E5450 (3.0GHz) (2CPU, 8 cores) 12GB RAM (E) Power Mac G5 (2.5GHz) (2CPU, 4 cores) 4GB RAM
