Riron

主要 keyword 解説

Keyword を使った例を探す方法

/g94/g94/tests/com に test0xxx.com という file があります。ここから実行を指定する Route section という部分を拾ったものから検索すると良いです。

% cd /g94/g94/tests/com
% grep # *.com
% grep -i keyword *.com

等も使えます。grep の -i option は比較中に大文字と小文字を区別しません。

opt: 構造の最適化

opt を使います。opt と力を計算する方法を組み合わせて使います。力を計算する方法を指定しないと、default の Berny Algorithm を内部座標系 (z-matrix) で実行します。これは、opt=z-matrix と指定したのと同じです。


# pm3 opt      ==> mopac で PM3 を指定するのと同じです。

# opt=z-matrix ==> Berny Algorithm を用いる。



計算方法の選択枝は、UR p.115 参照。

                         ----------------------------
                         !    Initial Parameters    !
                         ! (Angstroms and Degrees)  !
 ------------------------                            -------------------------
 ! Name  Definition              Value          Derivative Info.             !
 -----------------------------------------------------------------------------
 ! R1    R(2,1)                  0.96           calculate D2E/DX2 analyticall!
 ! R2    R(3,1)                  0.96           calculate D2E/DX2 analyticall!
 ! A1    A(2,1,3)              109.4712         calculate D2E/DX2 analyticall!
 -----------------------------------------------------------------------------

                         ----------------------------
                         !   Optimized Parameters   !
                         ! (Angstroms and Degrees)  !
 ------------------------                            -------------------------
 ! Name  Definition              Value          Derivative Info.             !
 -----------------------------------------------------------------------------
 ! R1    R(2,1)                  1.0135         -DE/DX =    0.               !
 ! R2    R(3,1)                  1.0135         -DE/DX =    0.               !
 ! A1    A(2,1,3)               97.2737         -DE/DX =    0.               !
 -----------------------------------------------------------------------------